Module de saisie protocolée

De Biolovision
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Remarques initiales

Le module de saisie protocolée permet la saisie d'une série de donnée en fonction d'un protocole pré-défini. Elle permet de collecter des données sur la base de point d'écoute, de transect ou de surface. Des informations complémentaires sur l'habitat ou la météo peuvent être demandées. Dans tous les cas, la pression d'observation est obligatoirement renseignée mais parfois contrainte sur la durée, c'est donc une fonction dérivée de la saisie par formulaires journaliers.

Chaque protocole est composé d'un groupe de point d'écoute / transect / surface associée à un groupe taxonomique. Par exemple, nous pouvons imaginer un protocole défini par 10 points d'écoute de 5 minutes pour les oiseaux ainsi que 9 transects pour les mammifères entre les points (C'est le cas du protocole STOC EPS). Un résumé reprend les différentes configurations existantes. 

Pour chaque protocole pré-défini, il existe deux droits d'accès :

  • un pour l'utilisateur normal qui peut gérer (créer / renseigner / modifier) les formulaires qu'il a créé.
  • un pour l'administrateur du protocole qui peut gérer tous les formulaires associés à ce protocole.

Un "super lieu-dit" est automatiquement créé pour rassembler tous les points/transects d’un protocole. Cela permet de faire une extraction sur tous les points d’un coup.

Protocoles supportés

Liste des paramétrages disponibles pour construire les différents protocoles

Nom du paramétrage Type Valeur par défaut Explication
Code du protocole nombre entier automatique numéro d'identificationn du protcole
Nom du protocole chaine de caracatères (45) - nom décrivant le protocole
Nombre de points minimum nombre entier 0 si le protocole contient des points d'écoute, le nombre minimum de points autorisés
Nombre de points maximum nombre entier 0 si le protocole contient des points d'écoute, le nombre maximum de points autorisés
Temps pour le point nombre entier (minute) - si le temps d'un point d'écoute est contraint, le chiffre indique le temps en minute, sinon NULL
Groupe taxonomique pour le point nombre entier 1 (oiseaux) indiquez le groupe taxonomique du/des points d'écoutes
Groupe taxonomique secondaire pour le point nombre entier - indiquez un groupe taxonomique secondaire pour le point (en plus du groupe précédent)
Nombre de transects minimum nombre entier 0 si le protocole contient des transects, le nombre minimum de transects autorisés
Nombre de transects maximum nombre entier 0 si le protocole contient des transect, le nombre maximum de transects autorisés
Temps pour le transect nombre entier (minute) - si le temps d'un transect est contraint, le chiffre indique le temps en minute, sinon NULL
Groupe taxonomique pour le transect nombre entier 1 (oiseaux) indiquez le groupe taxonomique du/des transects
Groupe taxonomique secondaire pour le transect nombre entier - indiquez un groupe taxonomique secondaire pour le transect (en plus du groupe précédent)
Nombre de polygones minimum nombre entier 0 si le protocole contient des polygones, le nombre minimum de polygones autorisés
Nombre de polygones maximum nombre entier 0 si le protocole contient des polygones, le nombre maximum de polygones autorisés
Temps pour le polygones nombre entier (minute) - si le temps d'un polygones est contraint, le chiffre indique le temps en minute, sinon NULL
Groupe taxonomique pour le polygones nombre entier 1 (oiseaux) indiquez le groupe taxonomique du/des polygones
Groupe taxonomique secondaire pour le polygones nombre entier - indiquez un groupe taxonomique secondaire pour le polygone (en plus du groupe précédent)
Pointage précis autorisé booléen -
Nombre de passage nombre entier -
Code projet nombre entier - Permet d'assigner automatiquement un projet à toutes les données du protocole
Masquage automatique booléen - Les données du protocole sont masquées automatiquement
Couche de délimitation chaine de caractères (15) - Si la surface est prédéfinie, il est possible de récupérer automatiquement le périmètre sous jascent
Taille de la grille nombre entier - Permet d'afficher automatiquement une grille sur la carte
REQUIRE_DETAIL booléen 1
ONLY_ADMIN_CREATE booléen 0
DAILY_LIST_SPECIES booléen 0
DAILY_LIST_SPECIES_FILTER booléen 0
EXTENDED_SPECIES_LIST booléen 0
FIXED_SPECIES_LIST booléen 0
Mois de début nombre entier 6 (juin) décrit le mois du premier recensement
COLOR nombre entier chaine de caractères (6)
DEFAULT_ATLAS_CODE nombre entier 0
USE_ADVANCED booléen 0
HABITAT ('none','stoc') 'none'
Méthode de saisie ('unique_detail','detail','distance','calling','section') 'detail'
Météo ('none','stoc') 'none'
TRANSPORT ('none','stoc') 'none'
POPUP_NO_VALUE Booléen 0

Ce tableau présente un rapide résumé des différentes configurations existantes :


ID du protocole Code du protocole Nom du protocole Nombre de points d'écoute Durée imposée de chaque point d'écoute Nombre de transects Durée imposée de chaque transect Nombre de polygone Durée imposée de chaque polygone Nombre de passage annuel
1 STOC_EPS STOC EPS 10 points oiseaux 5 minutes 9 transects mammifères indéterminée - - 3
7 STOC ONF STOC ONF 10 points oiseaux 5 minutes 9 transects mammifères indéterminée - - 3
2 SHOC SHOC - - 10 transects oiseaux indéterminée - - 2
3 STOC_SITES STOC Sites 5 - 30 points oiseaux 5 minutes - - - - indéterminé
4 STOC_MONTAGNE STOC Montagne 10 points oiseaux 10 minutes - - - - 2
5 GENERIC_BIRD générique oiseaux 0 - 50 points oiseaux indéterminée 0 - 50 transects oiseaux indéterminée 0 - 50 polygones oiseaux indéterminée indéterminé
6 LAGOPUS_MOTA Lagopède Alpin 1 point oiseau indéterminée - - - - 2
10 TETRAO_TETRIX Tétras lyre 1 point oiseau indéterminée - - - - 2
8 PTAKI_LESNE PTAKI LESNE - - - - 1 polygone oiseaux indéterminée 4
9 WATERBIRD Wetlands - - - - 1 polygone oiseaux indéterminée indéterminé
11 GLC GLC - - 1 transect oiseaux indéterminée - - indéterminé
12 NOU_ATLES_DIURN NOU_ATLES_DIURN - - - - 5 polygones oiseaux 1 heure 2
13 NOU_ATLES_NOCTURN NOU_ATLES_NOCTURN - - - - 2 polygones oiseaux 1 heure 1
14 BVM BVM 3 - 23 points oiseaux 5 minutes - - - - 2
15 SOCC SOCC - - 1 transect oiseaux - - - 4
16 PSMD PSMD - - 1 transect papillons - - - 10


Instructions détaillées par protocole

STOC EPS (1)

STOC ONF (7)

SHOC (2)

STOC Sites (3)

STOC Montagne (4)

générique oiseaux (5)

Lagopède alpin (6)

Tétra lyre (10)

PTAKI LESNE (8)

Wetlands (9)

GLC (11)

Nou atles diurn (12)

Nou atles nocturn (13)

BVM (14)

SOCC (15)

Programa de Seguimiento de Mariposas Diurnas (PSMD) (16)

Import d'un fichier shp

Le fichier shape doit être compatible avec le protocol choisi. Par exemple, le protocole Wetland attend des polygones, il faut donc que le shape contiennent des polygones.

Attention, aujourd'hui le module ne supporte que l'encodage UTF-8. Le système ne vérifie rien et assume que le fichier est correct. Vérifiez donc bien que c'est le cas sinon les caractères accentués peuvent devenir des symboles cabalistiques.

L'ID de référence est obligatoire (alphanumérique), mais si un nom personnalisé est donné, le nom personnalisé est utilisé comme ID de référence.


Masque d'import d'un shapefile


FAQ

Puis-je utiliser le formulaire protocole pour un autre emploi?

Non car les protocoles SHOC et STOC EPS sont synchronisés en temps réel avec le site vigieplume du Muséum d’Histoire Naturelle et si cela ne concerne pas les protocoles sus mentionnés, les données sont susceptibles d’être effacées !

En cas d'oubli après validation du formulaire

Consultez vos observations dans les menus prévus (Toutes mes données ou consultations multicritères) et sélectionnez l’icône « Editer la donnée » (Figure 1) La page Détail de l’observation s’ouvre et en cliquant sur l’icône «  ajouter une espèce au formulaire » vous pouvez ajouter les espèces manquantes sur le même point d’écoute ou transect pour le même relevé ! (Figure 2) Malgré la mention non obligatoire, il faut renseigner le nombre et la distance comme dans le formulaire protocolé, le système vous le demandera en cas d'oubli. (Figure 3)

Figure 1
Figure 2
Figure 3
Supprimer/ modifier une donnée dans le cadre d'un protocole

Dans "Toutes mes observations"

Pour suppression: cliquer sur le bouton "effacer la donnée" (flèche orange) Pour modification: cliquer sur le bouton "Editer la donnée" (flèche verte)

One data protocol delete.png
Suppression d'un formulaire complet

Dans toutes mes observations cliquer sur l’icône « effacer le formulaire » adjacent à une observation du formulaire en question.

All data protocol delete.png
En cas d'insertion d'une espèce par erreur dans le formulaire

Si une espèce non observée a été insérée dans la liste par erreur, il suffit de ne pas renseigner le nombre d’individus et la ligne n'est pas prise en compte.

Puis-je effacer un carré crée par erreur

Il n'est pas possible d'effacer un carré faisant partie d'un protocole.

Afin d'éviter une saisie protocolée non désirée sur ce carré, il faut le laisser sans observateur, ainsi la saisie protocolée sur ce carré n'est pas possible.


Aller dans le menu "Administration" puis "Utilisateurs/site" cliquer sur "Editer" (rond rouge) du carré concerné et effacer l'observateur si il y en a un.

Enlever observateur.png
J'ai 2 carrés identiques et je ne sais pas lequel contient des observations!

Afin de vérifier si le carré contient des observations protocolées, aller dans la partie "Administration" puis "Sites" Noter le numéro des carrés concernés (Code site, flèche orange)

Trouver nunero carre.png

Aller ensuite dans "Administrations" puis "Vérification des données"

choisir le site selon son numéro (flèche orange, Figure 1) puis cliquer sur "Afficher" (flèche jaune)

Si aucun graphique n'apparaît (rond rouge sur Figure 1), il n'y a pas de données, sinon un graphique avec des carrés colorés indiquant les jours comptant des relevés s'affichent. (entouré en rouge sur Figure 2)

On peut directement cliquer dessus pour obtenir le détail des observations.

Figure 1
Figure 2
Que puis-je faire avec les droits d'admin d'un protocole
  1. Il donne accès au sous-menu décrit ici : Menu d'administration des protocoles. Un menu par protocole auquel l'utilisateur à accès est affiché. Ce menu n'est visible que si l'observateur à le droit d'accès admin généralisé (et non localisé à une commune/canton/département).
  2. Il peut faire un export des données spécifiques aux protocoles auquel il à accès. Ce comprend en particulier le nom de chaque sous-site du protocole ainsi que le nom local de ces mêmes sous-sites (si utilisé)
  3. Il permet de faire une recherche en limitant aux données liés aux protocoles auquel il à accès. Ceci ouvre la porte aux exports décrit dans le point précédent. (Il faut faire une recherche limitée à un protocole pour pouvoir exporter les données spécifiques liée à ce protocole)
  4. Un administrateur d'un protocole voit tous les sites liés à ce protocole sur la carte quand il navigue. (L'utilisateur normal du protocole voit uniquement les sites qui lui sont attribués (par un administrateur du protocole en question). Ce droit est générique mais il peut être reteint à une ou plusieurs communes par un administrateur de la base.
  5. Depuis le menu décrit au point 1), il peut accéder à une synthèse de tous les recensements saisis par les différentes personnes ayant le droit de saisir des données pour le protocole. Ce droit est générique mais il peut être reteint à une ou plusieurs communes par un administrateur de la base (idem qu'au point précédent).
  6. Depuis le menu décrit au point 1), avec les droits non localisé (c'est à dire non limité un à une commune/département/région/province), il peut changer les paramétrages du protocole, par exemple activer/désactiver la saisie de la hauteur de neige ou ce genre de chose.
  7. Depuis le menu décrit au point 1), il est possible d'attribuer des observateurs au protocole. Cette personne aura alors le droit d'accès à la saisie des données pour le protocole en question. Elle pourra également créer un nouveau site qui sera associé au protocole. Il est toutefois possible de limiter cette dernière option aux administrateurs du protocole seulement.
  8. Depuis le menu décrit au point 1), il est possible d'importer des polygones depuis un shapfile (pour les protocoles qui utilisent des polygones)